Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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