Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms