Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDM7Q9NQW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRDM7Q9NQW5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDM7Q9NQW5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDM7Q9NQW5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDM7Q9NQW5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDM7Q9NQW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms