Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms