Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR2Q2VWA4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms