Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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