Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3P61158 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3P61158 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms