Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ACTR3P61158 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ACTR3P61158 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ACTR3P61158 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ACTR3P61158 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACTR3P61158 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACTR3P61158 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ACTR3P61158 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ACTR3P61158 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ACTR3P61158 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ACTR3P61158 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACTR3P61158 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACTR3P61158 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ACTR3P61158 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ACTR3P61158 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTR3P61158 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ACTR3P61158 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ACTR3P61158 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTR3P61158 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTR3P61158 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACTR3P61158 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ACTR3P61158 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTR3P61158 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ACTR3P61158 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTR3P61158 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTR3P61158 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTR3P61158 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTR3P61158 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTR3P61158 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTR3P61158 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTR3P61158 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTR3P61158 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTR3P61158 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR3P61158 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ACTR3P61158 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ACTR3P61158 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTR3P61158 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTR3P61158 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTR3P61158 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTR3P61158 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTR3P61158 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTR3P61158 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTR3P61158 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTR3P61158 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTR3P61158 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTR3P61158 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTR3P61158 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTR3P61158 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTR3P61158 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTR3P61158 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTR3P61158 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTR3P61158 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTR3P61158 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTR3P61158 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR3P61158 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTR3P61158 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTR3P61158 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTR3P61158 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTR3P61158 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTR3P61158 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTR3P61158 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTR3P61158 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTR3P61158 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTR3P61158 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTR3P61158 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACTR3P61158 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACTR3P61158 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTR3P61158 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACTR3P61158 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACTR3P61158 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTR3P61158 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTR3P61158 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTR3P61158 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTR3P61158 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTR3P61158 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTR3P61158 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTR3P61158 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTR3P61158 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTR3P61158 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTR3P61158 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTR3P61158 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTR3P61158 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACTR3P61158 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTR3P61158 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTR3P61158 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTR3P61158 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTR3P61158 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTR3P61158 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms