Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms