Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA6A0AVT1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA6A0AVT1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms