Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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