Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.046e-7■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.136e-7■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SEMA4G-207ENST00000518244 652 ntTSL 321.49■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SEMA4G-206ENST00000518124 596 ntTSL 319.91■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SEMA4G-209ENST00000519649 2024 ntTSL 515.22■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 221.37■■□□□ 1.012e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-212ENST00000564035 786 ntTSL 218.3■□□□□ 0.526e-16■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 222.99■■□□□ 1.271e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 321.09■□□□□ 0.977e-11■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.161e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.175e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.241e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.495e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.625e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.645e-10■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 46.85□□□□□ -1.311e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 55.25□□□□□ -1.571e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 PHF19-207ENST00000456291 888 ntTSL 326.31■■□□□ 1.82e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SLC38A5-211ENST00000615300 797 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 SLC38A5-206ENST00000480105 894 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 412.8□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 RACK1-221ENST00000509148 888 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 PRRC2A-207ENST00000469501 347 ntTSL 510.29□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 RACK1-216ENST00000507273 358 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 NDST2-206ENST00000465929 527 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 COASY-204ENST00000585909 570 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 PTBP1-213ENST00000587191 357 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-8■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.326e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.976e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.46e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.346e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AAAS-220ENST00000552876 2016 ntTSL 215.52■□□□□ 0.086e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.046e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 AAAS-212ENST00000548931 1075 ntTSL 513.57□□□□□ -0.246e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 TPST2-206ENST00000445720 675 ntTSL 29.8□□□□□ -0.846e-6■■□□□ 14.1
PCBP1Q15365 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 223.73■■□□□ 1.394e-45■■□□□ 14
PCBP1Q15365 RAVER1-202ENST00000585935 470 ntTSL 319.9■□□□□ 0.781e-15■■□□□ 14
PCBP1Q15365 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-15■■□□□ 14
PCBP1Q15365 RAVER1-205ENST00000593136 500 ntTSL 515.1■□□□□ 0.011e-15■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.074e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 14
PCBP1Q15365 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 14
PCBP1Q15365 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.628e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.022e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.472e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.062e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.922e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.872e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.842e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-209ENST00000590049 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.41□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CAPNS1-210ENST00000590211 403 ntTSL 55.4□□□□□ -1.542e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 LGALS3BP-208ENST00000588198 1132 ntTSL 215.27■□□□□ 0.045e-10■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-16■■□□□ 14
PCBP1Q15365 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-16■■□□□ 14
PCBP1Q15365 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-16■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CTSD-205ENST00000438213 946 ntTSL 218.16■□□□□ 0.57e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.899e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.039e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.039e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.849e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.849e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-206ENST00000578684 866 ntTSL 320.09■□□□□ 0.819e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-219ENST00000584689 1033 ntTSL 219.83■□□□□ 0.779e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 517.02■□□□□ 0.329e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 HUWE1-204ENST00000426907 4805 ntTSL 59.3□□□□□ -0.924e-9■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.996e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 14
PCBP1Q15365 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.566e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-11■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-11■■□□□ 14
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 200.5 ms