Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CUL1Q13616 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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