Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1BP22528 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms