Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCL3P20749 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms