Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPGDP15428 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPGDP15428 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPGDP15428 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPGDP15428 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms