Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
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