Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-9■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-9■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.834e-9■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-7■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.354e-7■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.894e-7■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.254e-7■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 HLA-C-207ENST00000484378 862 nt31.58■■■□□ 2.651e-6■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 HLA-C-209ENST00000495835 1073 nt27.04■■□□□ 1.921e-6■■□□□ 14.3
PCBP1Q15365 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.611e-6■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 317.59■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 14.3
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PCBP1Q15365 MBOAT7-204ENST00000414665 876 ntTSL 222.7■■□□□ 1.221e-6■■□□□ 14.2
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PCBP1Q15365 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-14■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 CDK16-206ENST00000462827 664 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-14■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 CDK16-203ENST00000428400 3016 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-14■■□□□ 14.2
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PCBP1Q15365 TMEM214-209ENST00000460904 506 ntTSL 312.01□□□□□ -0.493e-22■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.347e-12■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 519.41■□□□□ 0.73e-19■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-25■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.185e-19■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC9.63□□□□□ -0.875e-19■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 SERPINF2-204ENST00000453066 842 ntTSL 519.23■□□□□ 0.672e-16■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 SERPINF2-205ENST00000453723 838 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-16■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 217.11■□□□□ 0.336e-17■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-17■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.826e-17■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 59.08□□□□□ -0.966e-17■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.435e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-205ENST00000523182 2329 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.025e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RAB11FIP1-204ENST00000522774 3078 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.635e-20■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.536e-7■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.386e-7■■□□□ 14.2
PCBP1Q15365 RPS5-203ENST00000596314 718 ntTSL 517.02■□□□□ 0.326e-7■■□□□ 14.2
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