Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms