Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRE11P49959 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms