Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms