Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCF-201ENST00000327470 4269 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP1-202ENST00000393430 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01480-201ENST00000483481 467 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SUSD2P2-201ENST00000611186 758 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP10-12-202ENST00000618832 282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.190-201ENST00000620330 287 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02554-201ENST00000426467 5052 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A2-202ENST00000379906 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN2-232ENST00000640428 4146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms