RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.85□□□□□ -0.19
CCR6-201ENST00000341935 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.15□□□□□ -0.46
CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCR6-201ENST00000341935 ABCC9O60706 1549 aa11.5□□□□□ -0.57
CCR6-201ENST00000341935 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.46□□□□□ -0.57
CCR6-201ENST00000341935 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.4□□□□□ -0.58
CCR6-201ENST00000341935 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.35□□□□□ -0.59
CCR6-201ENST00000341935 NACADO15069 1562 aa11.31□□□□□ -0.6
CCR6-201ENST00000341935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.23□□□□□ -0.61
CCR6-201ENST00000341935 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.21□□□□□ -0.61
CCR6-201ENST00000341935 SCRIBQ14160 1630 aa11.14□□□□□ -0.63
CCR6-201ENST00000341935 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.04□□□□□ -0.64
CCR6-201ENST00000341935 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.89□□□□□ -0.67
CCR6-201ENST00000341935 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
CCR6-201ENST00000341935 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.75□□□□□ -0.69
CCR6-201ENST00000341935 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CCR6-201ENST00000341935 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CCR6-201ENST00000341935 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CCR6-201ENST00000341935 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.69□□□□□ -0.7
CCR6-201ENST00000341935 SMARCA4P51532 1647 aa10.68□□□□□ -0.7
CCR6-201ENST00000341935 WIZO95785 1651 aa10.62□□□□□ -0.71
CCR6-201ENST00000341935 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CCR6-201ENST00000341935 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.55□□□□□ -0.72
CCR6-201ENST00000341935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CCR6-201ENST00000341935 SMARCA2P51531 1590 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-201ENST00000341935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.49□□□□□ -0.73
CCR6-201ENST00000341935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CCR6-201ENST00000341935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.43□□□□□ -0.74
CCR6-201ENST00000341935 HMGXB3Q12766 1538 aa10.42□□□□□ -0.74
CCR6-201ENST00000341935 NCAPD3P42695 1498 aa10.41□□□□□ -0.74
CCR6-201ENST00000341935 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.38□□□□□ -0.75
CCR6-201ENST00000341935 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.24□□□□□ -0.77
CCR6-201ENST00000341935 PRDM2Q13029 1718 aa10.21□□□□□ -0.78
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CCR6-201ENST00000341935 ABCC8Q09428 1581 aa10.14□□□□□ -0.79
CCR6-201ENST00000341935 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.13□□□□□ -0.79
CCR6-201ENST00000341935 TRIM41Q8WV44 630 aa10.11□□□□□ -0.79
CCR6-201ENST00000341935 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.1□□□□□ -0.79
CCR6-201ENST00000341935 SLC24A1O60721 1099 aa10.1□□□□□ -0.79
CCR6-201ENST00000341935 NESP48681 1621 aa10.08□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 MYT1Q01538 1121 aa10.08□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 SYNJ1O43426 1573 aa10.06□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.04□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.04□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 TOP2BQ02880 1626 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-201ENST00000341935 CUX1P39880 1505 aa10.01□□□□□ -0.81
CCR6-201ENST00000341935 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10□□□□□ -0.81
CCR6-201ENST00000341935 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.99□□□□□ -0.81
CCR6-201ENST00000341935 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-201ENST00000341935 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 TOPBP1Q92547 1522 aa9.92□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 SOGA1O94964 1423 aa9.92□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-201ENST00000341935 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.89□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 EEA1Q15075 1411 aa9.89□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.89□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 ERCC6Q03468 1493 aa9.87□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 WDR62O43379 1518 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 WDR97A6NE52 1622 aa9.84□□□□□ -0.83
CCR6-201ENST00000341935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.83□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.82□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 KIF27Q86VH2 1401 aa9.82□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.82□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 CUX2O14529 1486 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 KIF21BO75037 1637 aa9.8□□□□□ -0.84
CCR6-201ENST00000341935 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.77□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.77□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA3Q08378 1498 aa9.76□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 IFT140Q96RY7 1462 aa9.75□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 PRXQ9BXM0 1461 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 IGF1RP08069 1367 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.72□□□□□ -0.85
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CCR6-201ENST00000341935 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.72□□□□□ -0.85
CCR6-201ENST00000341935 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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CCR6-201ENST00000341935 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.7□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 GRIN2BQ13224 1484 aa9.66□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 CEP162Q5TB80 1403 aa9.65□□□□□ -0.86
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS12P58397 1594 aa9.64□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.61□□□□□ -0.87
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