Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TDRD1-203ENST00000369282 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL2-201ENST00000216237 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3B2-202ENST00000535348 3254 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGFR-201ENST00000370756 4450 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM1-204ENST00000614490 4196 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CAPS-203ENST00000588776 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG2-204ENST00000357544 4678 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 C3P1-201ENST00000495140 3526 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC152007.1-201ENST00000428521 224 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms