RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MT-TS1-201ENST00000387416 SMARCA2P51531 1590 aa16.03■□□□□ 0.16
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MT-TS1-201ENST00000387416 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.36■□□□□ 0.05
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MT-TS1-201ENST00000387416 PRDM2Q13029 1718 aa15.29■□□□□ 0.04
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MT-TS1-201ENST00000387416 TOPBP1Q92547 1522 aa15.1■□□□□ 0.01
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MT-TS1-201ENST00000387416 IFT140Q96RY7 1462 aa15.08■□□□□ 0
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MT-TS1-201ENST00000387416 OSCARQ8IYS5 282 aa14.94□□□□□ -0.02
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MT-TS1-201ENST00000387416 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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MT-TS1-201ENST00000387416 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.9□□□□□ -0.02
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR97A6NE52 1622 aa14.88□□□□□ -0.03
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MT-TS1-201ENST00000387416 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.87□□□□□ -0.03
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MT-TS1-201ENST00000387416 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
MT-TS1-201ENST00000387416 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.8□□□□□ -0.04
MT-TS1-201ENST00000387416 TOP2BQ02880 1626 aa14.8□□□□□ -0.04
MT-TS1-201ENST00000387416 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.78□□□□□ -0.04
MT-TS1-201ENST00000387416 GRIN2BQ13224 1484 aa14.78□□□□□ -0.04
MT-TS1-201ENST00000387416 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.76□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 FBLN2P98095 1184 aa14.75□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 SYNJ1O43426 1573 aa14.73□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.71□□□□□ -0.05
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD1O14646 1710 aa14.69□□□□□ -0.06
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.69□□□□□ -0.06
MT-TS1-201ENST00000387416 SYNJ2O15056 1496 aa14.69□□□□□ -0.06
MT-TS1-201ENST00000387416 PBRM1Q86U86 1689 aa14.66□□□□□ -0.06
MT-TS1-201ENST00000387416 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.62□□□□□ -0.07
MT-TS1-201ENST00000387416 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.6□□□□□ -0.07
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM41Q8WV44 630 aa14.6□□□□□ -0.07
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF11O15085 1522 aa14.59□□□□□ -0.07
MT-TS1-201ENST00000387416 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.58□□□□□ -0.08
MT-TS1-201ENST00000387416 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.58□□□□□ -0.08
MT-TS1-201ENST00000387416 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.58□□□□□ -0.08
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF27Q86VH2 1401 aa14.57□□□□□ -0.08
MT-TS1-201ENST00000387416 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.56□□□□□ -0.08
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MT-TS1-201ENST00000387416 ADAMTS12P58397 1594 aa14.56□□□□□ -0.08
MT-TS1-201ENST00000387416 NUP160Q12769 1436 aa14.51□□□□□ -0.09
MT-TS1-201ENST00000387416 IGF1RP08069 1367 aa14.51□□□□□ -0.09
MT-TS1-201ENST00000387416 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.5□□□□□ -0.09
MT-TS1-201ENST00000387416 CUL7Q14999 1698 aa14.46□□□□□ -0.1
MT-TS1-201ENST00000387416 ARAP1Q96P48 1450 aa14.45□□□□□ -0.1
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP170Q5SW79 1584 aa14.44□□□□□ -0.1
MT-TS1-201ENST00000387416 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.43□□□□□ -0.1
MT-TS1-201ENST00000387416 JPH4Q96JJ6 628 aa14.41□□□□□ -0.1
MT-TS1-201ENST00000387416 SHROOM2Q13796 1616 aa14.39□□□□□ -0.11
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.38□□□□□ -0.11
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