Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms