Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18B1Q6NT16 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms