Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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