Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms