Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms