Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 TRIO-222ENST00000515144 7455 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 525.68■■□□□ 1.71e-7■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 DHX33-204ENST00000574023 2040 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.124e-9■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.854e-9■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-9■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 DHX33-203ENST00000572490 2564 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.294e-9■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 NPLOC4-203ENST00000570300 565 ntTSL 412.74□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.119e-7■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 EIF4B-206ENST00000549592 1901 ntTSL 213.01□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 22.5
U2AF2P26368 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 226.91■■□□□ 1.91e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 223.95■■□□□ 1.431e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.41□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 SLC35F5-205ENST00000447673 725 ntTSL 33.14□□□□□ -1.918e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.479e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.039e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.479e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.539e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ARHGAP5-211ENST00000557643 872 ntTSL 33.14□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.056e-10■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PROSER1-202ENST00000418503 898 ntTSL 328.93■■■□□ 2.227e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PROSER1-209ENST00000602534 576 ntTSL 22.71□□□□□ -1.987e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.836e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FNDC3A-201ENST00000378383 2037 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.396e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 522.81■■□□□ 1.246e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.26e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.166e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 520.06■□□□□ 0.86e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 517.26■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 515.83■□□□□ 0.126e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 415.05■□□□□ -06e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 414.33□□□□□ -0.126e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 511.72□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ACAP2-216ENST00000635383 1647 ntTSL 58.87□□□□□ -0.993e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ACAP2-204ENST00000439758 766 ntTSL 46□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 NEDD4L-228ENST00000590248 730 ntTSL 215.3■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ABCC3-213ENST00000513589 582 ntTSL 414.88□□□□□ -0.031e-13■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 DNHD1-203ENST00000472080 2288 ntTSL 211.68□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.31e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.061e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 519.86■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.866e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.893e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 CYP4V2-203ENST00000507209 8646 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.45e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCF11-205ENST00000530906 628 ntTSL 36.43□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MSH5-SAPCD1-206ENST00000491552 706 ntTSL 318.38■□□□□ 0.539e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 316.39■□□□□ 0.219e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 513.72□□□□□ -0.219e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 311.32□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 SLC25A26-204ENST00000464350 3879 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ADSS-202ENST00000462358 932 ntTSL 55.46□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PIEZO2-212ENST00000582913 8465 ntTSL 510.5□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.987e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.131e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.048e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MTERF2-204ENST00000548101 715 ntTSL 319.8■□□□□ 0.768e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.678e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MTERF2-205ENST00000550496 418 ntTSL 318.62■□□□□ 0.578e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCCA-215ENST00000637657 2118 ntTSL 515.79■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.038e-9■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 413.67□□□□□ -0.227e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 GOT1-202ENST00000471741 716 ntTSL 211.87□□□□□ -0.511e-7■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 PCCA-211ENST00000636366 1654 ntTSL 511.71□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 22.4
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 254.5 ms