Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTMSP20962 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTMSP20962 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTMSP20962 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTMSP20962 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms