Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KIF3AQ9Y496 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIF3AQ9Y496 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3AQ9Y496 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms