Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3HCC1Q9Y3T6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
R3HCC1Q9Y3T6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HCC1Q9Y3T6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms