Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCA2Q9UQC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA2Q9UQC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA2Q9UQC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA2Q9UQC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms