Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXO1Q9UQ84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXO1Q9UQ84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXO1Q9UQ84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms