Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX6Q9UNH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX6Q9UNH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX6Q9UNH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms