Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKLN1Q9UL63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKLN1Q9UL63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKLN1Q9UL63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKLN1Q9UL63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms