Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR3Q9UJK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSR3Q9UJK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR3Q9UJK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms