Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DNAI1Q9UI46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAI1Q9UI46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAI1Q9UI46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAI1Q9UI46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAI1Q9UI46 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms