Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAE1Q9UBE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAE1Q9UBE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAE1Q9UBE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAE1Q9UBE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms