Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBP1Q9NZI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBP1Q9NZI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBP1Q9NZI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBP1Q9NZI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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