Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf109Q9NX04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf109Q9NX04 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf109Q9NX04 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms