Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF13Q9NV06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCAF13Q9NV06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF13Q9NV06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF13Q9NV06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF13Q9NV06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms