Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-213ENST00000592023 738 ntTSL 523.28■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 323.24■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-217ENST00000592905 882 ntTSL 223.11■■□□□ 1.297e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-205ENST00000587888 556 ntTSL 522.29■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-210ENST00000448477 828 ntTSL 221.48■■□□□ 1.037e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 17e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NINJ1-202ENST00000461162 861 ntTSL 221.12■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 320.98■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-208ENST00000588003 510 ntTSL 320.95■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NINJ1-203ENST00000470314 834 ntTSL 320.46■□□□□ 0.877e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-207ENST00000467016 296 ntTSL 220.24■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-209ENST00000527167 1712 ntTSL 519.91■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 218.48■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 FER1L6-AS2-201ENST00000520031 1746 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.397e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 317.26■□□□□ 0.357e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NINJ1-205ENST00000490564 488 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 07e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-205ENST00000563677 557 ntTSL 414.58□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 312.55□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 210.9□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-205ENST00000442050 564 ntTSL 58.57□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 KPNB1-204ENST00000577875 605 ntTSL 37.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.787e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 GLRX2-203ENST00000472197 774 ntTSL 53.56□□□□□ -1.847e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.857e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 525.82■■□□□ 1.722e-7■■■■■ 52.6
DROSHAQ9NRR4 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 420.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 52.6
DROSHAQ9NRR4 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 52.6
DROSHAQ9NRR4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.46■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 52.5
DROSHAQ9NRR4 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 52.5
DROSHAQ9NRR4 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.3□□□□□ -1.242e-13■■■■■ 52.4
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-206ENST00000540900 2057 ntTSL 519.45■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 317.64■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-210ENST00000583301 684 ntTSL 317.18■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-202ENST00000394826 1800 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 512.49□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-212ENST00000584317 564 ntTSL 510.99□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 229.53■■■□□ 2.322e-10■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.552e-10■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 52.1
DROSHAQ9NRR4 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-16■■■■■ 51.4
DROSHAQ9NRR4 ZFHX4-AS1-204ENST00000522961 240 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-16■■■■■ 51.4
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 328.8■■■□□ 2.26e-7■■■■■ 51.4
DROSHAQ9NRR4 LRCH1-204ENST00000443945 2070 ntTSL 1 (best)27.65■■■□□ 2.021e-9■■■■■ 51.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.361e-9■■■■■ 51.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 51.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 51.3
DROSHAQ9NRR4 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 412.56□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 51.1
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.957e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.677e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.647e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 517.93■□□□□ 0.467e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-210ENST00000525198 981 ntTSL 517.65■□□□□ 0.427e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-217ENST00000527423 962 ntTSL 416.35■□□□□ 0.217e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.127e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.087e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -07e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-215ENST00000527017 727 ntTSL 514.62□□□□□ -0.077e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.787e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.87e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.17e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.137e-11■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 50.9
Retrieved 100 of 16,331 protein–RNA pairs in 335.1 ms