Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP3Q9NQ35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP3Q9NQ35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms