Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID1IP1Q9NPA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1IP1Q9NPA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1IP1Q9NPA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms