Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM27Q9HBJ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM27Q9HBJ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms