Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNDIG1Q9H7V2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1Q9H7V2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms