Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BCAS3Q9H6U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCAS3Q9H6U6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BCAS3Q9H6U6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms